Молекулярно-генетические и клинико-фенотипические особенности муковисцидоза в российских популяциях (22.12.2008)

Автор: Петрова Ника Валентиновна

Таблица 9.

Расчет вероятностей для новорожденного с положительным ИРТ тестом до проведения ДНК-тестирования.

Гипотеза для новорожденного поражен носитель неноситель

Априорная вероятность 0,000091 0,019 0,981

Условная вероятность положи-тельного результата теста на ИРТ ?1 0,041 0,011

Совместная вероятность (0,011661) 0,000091 0,000779 0,010791

Апостериорная вероятность 0,0078 0,0668 0,9254

В зависимости от результата ДНК-тестирования возможны три ситуации, при которых риск МВ при положительном результате первого теста на ИРТ у младенца будет следующим:

) все анализируемые мутации относятся к числу, обусловливающих классические симптомы при МВ. Но следует рекомендовать проведение ДНК-диагностики у родителей для подтверждения того, что они носители мутаций, обнаруженных у ребенка.

2). При обнаружении одной CFTR мутации риск МВ становится высоким (0,0541): в 7 раз выше, чем до проведения ДНК-анализа (0,0078), даже в популяции с относительно низкой частотой МВ (0,000091) и невысокой долей идентифицируемых CFTR мутаций (75,5%), как, например, если оба родителя происходят из европейской части России (табл. 10).

Таблица 10.

Расчет вероятностей новорожденного с положительным ИРТ тестом и одной идентифицированной CFTR мутацией.

Гипотеза для новорожденного поражен носитель неноситель

Априорная вероятность 0,000091 0,019 0,981

Условная вероятность обнаружения одной анализируемой мутации 0,544?0,245+

0,544?0,245 = 0,26656 0,544?1 0

Условная вероятность положительного результата теста на ИРТ ?1 0,041 0,011

Совместная вероятность

0,000448033 0,000024257 0,000423776 0

Апостериорная вероятность 0,0541 0,9459 0

Для дальнейшего уточнения можно рекомендовать проведение ДНК-диагностики у родителей. Обнаружение мутаций у обоих родителей будет подтверждением того, что ребенок является носителем одной мутации.

3). При не обнаружении анализируемых мутаций риск МВ снижается на порядок (0,0005), чем до проведения ДНК-тестирования (0,0078) (табл. 11).

Таблица 11.

Анализ вероятностей для новорожденного с положительным ИРТ тестом и не идентифицированными CFTR мутациями

Гипотеза для новорожденного поражен носитель неноситель

Априорная вероятность 0,000091 0,019 0,981

Условная вероятность отсутствия проанализированных мутаций 0,245?0,245 =

0,060025 0, 245?1 1

Условная вероятность положительного результата теста на ИРТ ?1 0,041 0,011

Совместная вероятность

0,01098731 0,00000546 0,00019085 0,010791

Апостериорная вероятность 0,000497 ? 0,0005 0,0174 0,9821

Следует отметить, что различие между вероятностями до и после проведения ДНК-диагностики тем выше, чем большую долю составляют проанализированные мутации среди всех мутантных аллелей в регионе. В Сибирском и Дальневосточном округах частоты МВ практически одинаковы (1,18?10-4 и 1,23?10-4, соответственно), но доля идентифицируемых мутаций в Сибирском округе существенно ниже, чем в Дальневосточном (0,60 и 0,73, соответственно) (табл. 8). Апостериорная вероятность поражения МВ для положительно тестированного на ИРТ новорожденного при отрицательном результате ДНК-типирования в Дальневосточном округе в 17,5 раза выше, чем до проведения молекулярно-генетического анализа (0,01019 и 0,00058, соответственно), тогда как в Сибирском округе это соотношение составляет 5,9 раза (0,01019 и 0,00172, соответственно).

Б). Расчет риска МВ при обнаружении гиперэхогенности кишечника у плода во II-III триместре внутриутробного развития

Одним из факторов риска МВ является гиперэхогенность кишечника, выявляемая при ультразвуковом обследовании плода во II-III триместре внутриутробного развития. Согласно данным литературы аномалии кишечника у плода являются фактором высокого риска МВ с тяжелым течением, и в таком случае рекомендован скрининг на CFTR мутации семьям, у плодов которых при рутинном скрининге обнаружена эхогенность кишечника (Muller F. et al., 2002; Scotet V. et al., 2002; Simon-Bouy B. et al., 2003). При расчетах риска МВ следует учитывать не только разную популяционную частоту МВ, но и разные вероятности быть пораженным, носителем или неносителем при положительном УЗИ-тесте, определенные в работе S. Ogino с соавторами и равные 0,11, 0,00089 и 0,00035, соответственно (Ogino S. et al., 2004).

Если оба родителя происходят из европейской части России, риск МВ для плода составляет 0,0270, т.е. почти в 300 раз выше, чем среднепопуляционный (0,000091). Поэтому рекомендуется проведение ДНК-тестирования у родителей. Возможны три результата ДНК-тестирования.

А). Если у обоих родителей обнаружены CFTR мутации, риск МВ у плода с гиперэхогенностью кишечника составляет 0,99, т.е. практически равен 1.

Б). Если один из родителей является носителем CFTR мутации, риск МВ у плода с гиперэхогенностью кишечника 0,1733 (табл. 12). Достаточно высокий риск, сравнимый с риском у семей, отягощенных МВ. Если в регионе, откуда происходят родители, частота МВ более высокая, а доля идентифицируемых мутаций относительно невелика, то вероятность поражения плода может быть еще выше (например, если оба родителя из Сибирского Федерального округа, она равна 0,2808).

Таблица 12.

Расчет вероятности для плода с положительным УЗИ тестом быть пораженным МВ, если один из родителей является носителем CFTR мутации, а у второго частые мутации не обнаружены.


загрузка...